Экономическая эффективность при системном подходе рассматривается как характеристика, присущая только всей системе ядерной энергетики, при этом реализуется принцип слабого звена, которое может привести к неприемлемым рискам за счет нецелостности подхода даже при наличии отдельных прорывных и конкурентоспособных на краткосрочной перспективе решений по отдельным частям структуры ЯЭ. В качестве экономического критерия при этом рассматривается базовый экономический принцип ИНПРО, согласно которому предлагаемые решения должны быть технически реализуемы и экономически доступны.